Resonance assignment of the Shank1 PDZ domain

Shank proteins are among the most abundant and well-studied postsynaptic scaffold proteins. Their PDZ domain has unique characteristics as one of its loop regions flanking the ligand-binding site is uniquely long and has also been implicated in the formation of PDZ dimers. Here we report the initial...

Teljes leírás

Bibliográfiai részletek
Szerzők:	Sánta Anna Czajlik András Batta Gyula Péterfia Bálint Gáspári Zoltán
Dokumentumtípus:	Cikk
Megjelent:	2022
Sorozat:	BIOMOLECULAR NMR ASSIGNMENTS 16 No. 1
Tárgyszavak:	Biokémia és molekuláris biológia
mtmt:	32625251
Online Access:	https://publikacio.ppke.hu/1621

Hasonló tételek

Ensemble-Based Analysis of the Dynamic Allostery in the PSD-95 PDZ3 Domain in Relation to the General Variability of PDZ Structures
Szerző: Dudola Dániel, et al.
Megjelent: (2020)

NMR-based assignment and protein dynamics measurement of the EVH1 domain of the postsynaptic Homer-1
Szerző: Maruzs Brigitta Alexandra
Megjelent: (2022)

A SHANK1 fehérje PDZ domén pontmutációk funkcionális hatásának bioinformatikai és kísérletes vizsgálata
Szerző: Varjassy Anna
Megjelent: (2023)

A Shank 1 PDZ domén interakciójának in silico és in vitro vizsgálata trunkált GKAP fehérje ligandumokkal
Szerző: Li Jessica Amy
Megjelent: (2023)

Ligand‐dependent intra‐ and inter‐domain motions in the PDZ12 tandem regulate binding interfaces in postsynaptic density protein‐95
Szerző: Kovács Bertalan, et al.
Megjelent: (2020)

Comparative analysis of binding induced changes in different PDZ domains
Szerző: Al Makhlouf Mounaf
Megjelent: (2024)

The Putative HORMA Domain Protein Atg101 Dimerizes and Is Required for Starvation-Induced and Selective Autophagy in Drosophila
Szerző: Hegedűs Krisztina, et al.
Megjelent: (2014)

A Shank fehérjecsalád szerkezeti működésének bioinformatikai és kísérletes vizsgálata
Szerző: Sánta Anna
Megjelent: (2016)

A posztszinaptikus Shank-1 és GKAP fehérjék interakciójának kísérletes vizsgálata
Szerző: Garamszegi Fanni
Megjelent: (2021)

Interaction of superconductive microwave resonators and qubits
Szerző: Mátyás Alpár
Megjelent: (2007)

MAP Kinase-Mediated Activation of RSK1 and MK2 Substrate Kinases
Szerző: Sok Péter Dániel, et al.
Megjelent: (2020)

Uncovering the direct domain-domain interactions in protein complexes
Szerző: Kozák Anna Franciska
Megjelent: (2015)

Metamaterial Resonator Based Microwave Sensing for Biological Application
Szerző: Incze Denissza
Megjelent: (2022)

Computing Different Realizations of Linear Dynamical Systems with Embedding Eigenvalue Assignment
Szerző: Szlobodnyik Gergely, et al.
Megjelent: (2022)

Charged sequence motifs increase the propensity towards liquid–liquid phase separation
Szerző: Szabó András László, et al.
Megjelent: (2022)

Stability,Optical Flow and Stochastic Resonance in Cellular Wave Computing
Szerző: Török Levente
Megjelent: (2005)

The theory of surface plasmon resonance based instruments and it's analysis of applications
Szerző: Gál Árpád László
Megjelent: (2009)

Estimating intrinsic structural preferences of de novo emerging random-sequence proteins Is aggregation the main bottleneck? /
Szerző: Kovácsné Ángyán Annamária Franciska, et al.
Megjelent: (2012)

Az Internetes domain-nevek
Szerző: Jásdi Attila
Megjelent: (2000)

DIPEND An Open-Source Pipeline to Generate Ensembles of Disordered Segments Using Neighbor-Dependent Backbone Preferences /
Szerző: Harmat Zita, et al.
Megjelent: (2021)

Test-time domain transfer for connectomics segmentation
Szerző: Joshi Smriti
Megjelent: (2021)

A szinaptikus plaszticitás kialakításában részt vevő PDZ domének interakcióinak prediktálása
Szerző: Onica Klaudia
Megjelent: (2015)

Kísérletileg meghatározott, belső dinamikát tükröző fehérjeszerkezeti sokaságok előállítás, elemzés és biológiai relevancia /
Szerző: Gáspári Zoltán
Megjelent: (2019)

Egyes posztszinaptikus állványfehérjék PDZ doménjeinek kísérletes előállítása és szerkezeti-fukcionális vizsgálata
Szerző: Hegedüs József
Megjelent: (2014)

Simulated complexes formed from a set of postsynaptic proteins suggest a localised effect of a hypomorphic Shank mutation
Szerző: Miski Marcell, et al.
Megjelent: (2024)

A posztszinaptikus Shank3 fehérje pontmutációk kóroki szerepének kísérletes és bioinformatikai vizsgálata
Szerző: Peágics Enikő Enid
Megjelent: (2025)

PSINDB The postsynaptic protein-protein interaction database /
Szerző: Kálmán Zsófia Etelka, et al.
Megjelent: (2022)

Proteostasis collapse, a hallmark of aging, hinders the chaperone-Start network and arrests cells in G1
Szerző: Moreno David F., et al.
Megjelent: (2019)

Unsupervised Domain Adaptation for the Segmentation of Breast Tissue in Mammography Images
Szerző: Ryan Frances Josephine
Megjelent: (2014)

Interoperability of CNN Classifiers in Spectral-Domain for Efficient Model Training
Szerző: Gebreamlak Meaza Eyakem
Megjelent: (2022)

Diversity of synaptic protein complexes as a function of the abundance of their constituent proteins A modeling approach /
Szerző: Miski Marcell, et al.
Megjelent: (2022)

Fine-tuning the extent and dynamics of binding cleft opening as a potential general regulatory mechanism in parvulin-type peptidyl prolyl isomerases
Szerző: Czajlik András, et al.
Megjelent: (2017)

Hybrid algorithms for preprocessing agglutinative languages and less-resourced domains effectively
Szerző: Orosz György
Megjelent: (2015)

Study of supra-domain organization in experimentally determined and modeled protein structures
Szerző: Keller Viktória
Megjelent: (2024)

Integrative analysis of yeast colony growth
Szerző: Gaizer Tünde Éva, et al.
Megjelent: (2024)

Directed Evolution-Driven Increase of Structural Plasticity Is a Prerequisite for Binding the Complement Lectin Pathway Blocking MASP-Inhibitor Peptides
Szerző: Dürvanger Zsolt, et al.
Megjelent: (2022)

A .hu top level domain autoritatív név szervereinek forgalmi elemzése
Szerző: Ikládi Ákos
Megjelent: (2010)

Meta-Learning for Domain Generalization with Style-based Parameter Prediction in Biomedical Image Segmentation
Szerző: Uzolas Lukas
Megjelent: (2021)

Structural and functional investigation of the GK domain of the post-synaptic density protein PSD-95
Szerző: Farkas Fanni
Megjelent: (2014)

Disentangling the complexity of low complexity proteins
Szerző: Pablo Mier, et al.
Megjelent: (2020)